La prolifération de certains organismes, souvent à cycles de développement courts, constitue un excellent outil de détection d'une pollution importante de nature organique ou minérale.

En présence de ces types de contamination, leur développement spectaculaire les rend facilement observables.

Organismes	Aspects macroscopiques	Nature de la pollution
Sphaerotilus sp.	Bactéries formant des touffes en "queues d'agneau" blanchâtres, gélatineuses au toucher et retenues par différents supports immergés	Pollution organique (essentiellement glucidique)
Beggiatoa alba et Thiothrix sp.  Chromatium sp.	bactéries constituant un voile blanc plus ou moins épais, au fond de l'eau bactéries formant des nuages rouges dans l'eau	eaux privées d'oxygène dissous et concentration importante en hydrogène sulfuré
Leptomitus lacteus	champignons présentant le même aspect que Sphaerotilus	pollution organique
Fusarium aquaeductum	champignons constituant des croûtes de couleur rouge en présence de fortes vitesses d'écoulement des eaux	pollution organique très importante
Cyanophycées	algues unicellulaires agglomérées dans une substance mucilagineuse recouvrant les différents substrats d'un enduit gluant de couleur vert-bleu ou vert-brun	pollution par matières organiques plus ou moins minéralisées
Aphanisomenon sp.	algues pluticellulaires non ramigfiées teintant les eaux stagnantes (étangs, lacs, canaux) en vert bleuté	éléments minéraux (sels de phosphore)
Spirogyra sp.  Clodophora sp.	algues pluricellulaires formant des filaments vert-brun, non ramifiés, visqueux au toucher algues pluricellulaires constituées de filaments vert sombre, ramifiés et rugueux au toucher	matière organique fortement minéralisée (sels d'azote et de phosphore)
Phanérogames (nymphéacée, Potamogeton sp., Ranunculus sp., Polygonum sp.)	plantes immergées ou flottantes envahissant les milieux aquatiques	éléments minéraux (sels d'azote et de phosphore)

Eléments d'appréciation pour l'étude de certains types de pollution à partir de bactéries, champignons, plantes vertes (D'après R. BONNARD, Cemagref)

Ces organismes sont pour la plupart des bactéries, des champignons et des plantes vertes (algues et phanérogames) et ne sont à considérer dans ce cas, que comme éléments d'appréciation pour l'étude de ces pollutions.

Certaines observations simples et rapides sur les poissons et les invertébrés apportent des éléments précieux de diagnostic.
     - Sur les poissons, on rappellera l'observation classique de mortalités massives ou limitées, dues à des déficits en oxygène ou à la présence de toxiques; les mortalités limitées peuvent être la conséquence de relargages de substances toxiques piégées dans les sédiments;
     - dans le cas des invertébrés, quelques observations simples se révèlent intéressantes.

Invertébrés	Observations	Habitats	Causes suspectées
Seuls présents : Dendrocoelidae Oligochètes Sangsues Aselidae Chironomidae	Prolifération d'un ou de plusieurs de ces organismes (1)	blocs ou pierres de bordures (cours d'eaux ou lacs) et dans le lit du cours d'eau	- pollution organique si plusieurs groupes sont présents - pollution mixte (organique + toxique) si un ou deux groupes sont présents
	Absence ou rareté de ces organismes (2)	blocs ou pierres de bordures (cours d'eaux ou lacs)	Effet de substances toxiques ou effet physique (batillage,...)
		Blocs ou pierres dans le lit du cours d'eau	Effet de substances toxiques

Eléments simples d'appréciation rapide de cas de pollutions à partir d'invertébrés (D'après M. LAFONT, Cemagref)

(1) En outre, un ou plusieurs groupes de ces organismes sont englués dans un biofilm d'algues et/ou de microorganismes, la pollution organique est sûre; l'absence ou une faible épaisseur du biofilm peut être la résultante d'une contamination par des toxiques;
(2) Ces organismes peuvent être absents lorsque des algues bleues sont présentes : ce sont alors les algues bleues qui constituent la cause principale de disparition de ces organismes.

REMARQUE : dans des têtes de réseau en bassin hydrographique cristallin, les Heptageniidae et beaucoup d'invertébrés sont absents en raison d'une acidification du milieu, en l'absence de toute forme de rejet.

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